由多种中药材依据中医“君、臣、佐、使”配伍原理制成的中草药制剂既可以提供作物营养，又可以防控病虫害。其有效成分为生物活性物质和微量矿物营养元素，可以使中药材恢复到健康生长状态，减少有害生物对其侵害，可以提高中药材抗病力并调节其健康生长，能增强中药的抗逆性，达到优质高产的目标。中草药制剂安全、高效、可靠、环保，连续使用病虫害不会产生抗性，不会破坏生态环境。中医农业克服了一般中药材种植不能有效抵御病虫害、不能高产的瓶颈，集成创新了生态中药材生产模式：一是将中药肥与天然矿物质营养肥组合施用，调理土壤理化性能，形成良好的土壤结构，既可以治理土壤重金属和其他污染，又可以促进作物次生代谢以产生化感物质增加中药材抗逆性、抗病性和功能性物质积累。二是以中药肥作为有机肥助剂，充分发挥有机碳对作物高产的重要作用，注重来自于农业有机剩余物的大量碳素有机肥投入；三是投放微生物复合菌群，既通过微生物分解土壤中的有机氮为作物提供氮素，又可以通过其中的固氮菌有效保证中药材对氮的大量需求。通过这种生态栽培模式，不仅不会发生重茬病和中药材种植中容易出现的病虫害，而且实现了稳定的高产出。在农业系统中，生态循环是关键，必须用中医健康循环理念来引导，才能构建出高效的中药材生态循环种植模式。例如“促进中药材生态链药性物质富集的中医农业技术集合”，由多项互为关联的以特定功能元素为中心、面向药性强化的中医农业技术构成，包括营养源中药材配方技术、微生物发酵技术、昆虫繁育转化技术等。该技术以“全域营养源”为原料，经过多重生物转化过程，借助多种生物体自身纯天然的生物降解、合成、富集和沉积作用等，转化形成以多种中药材和相关生态产品为载体、以功能元素为中心的特定药性富集中药材。当前，大面积单一中药材种植是造成病虫害和土壤养分失衡的主要原因。通过带状种植，既不影响机械化操作，又可以实现农田生物多样化并提升农业系统功能，充分发挥生物群落间双向化感效应，达到减轻病虫害、自然培肥土壤的目的。另外，通过立体种植中药材，可以在同一块田地上实现收益的多倍化。目前，我们中医农业基地在这方面有成熟的模式，并在全国多地推广，积累了丰富的经验。例如，采用中药材乔灌草立体种植，利用特定生物群落驱虫、杀虫、引虫、吃虫、抑制有害杂草；利用某些中药材的吸附性和喜欢适度遮阴特点，种植花香、草香、果香植物为中药材增香遮阴，创造一个适宜中药材的健康生态环境。